In aggiunta ai pacchetti, sono richieste anche molte patch. Queste patch, oltre a correggere errori riscontrati nei pacchetti dai relativi manutentori, apportano apportano anche piccole modifiche per rendere più facile lavorare con i pacchetti stessi. Saranno necessarie le seguenti patch per costruire un sistema LFS:
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/bash-3.0-fixes-3.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/bash-3.0-avoid_WCONTINUED-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/coreutils-5.2.1-suppress_uptime_kill_su-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/coreutils-5.2.1-uname-2.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/expect-5.43.0-spawn-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/flex-2.5.31-debian_fixes-3.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/gcc-3.4.3-linkonce-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/gcc-3.4.3-no_fixincludes-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/gcc-3.4.3-specs-2.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/glibc-2.3.4-fix_test-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/gzip-1.3.5-security_fixes-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/inetutils-1.4.2-kernel_headers-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/inetutils-1.4.2-no_server_man_pages-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/iproute2-2.6.11_050330-remove_db-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/mktemp-1.5-add_tempfile-2.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/perl-5.8.6-libc-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/readline-5.0-fixes-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/sysklogd-1.4.1-fixes-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/tar-1.15.1-sparse_fix-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/util-linux-2.12q-cramfs-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/vim-6.3-security_fix-1.patch
http://www.linuxfromscratch.org/patches/lfs/6.1/zlib-1.2.2-security_fix-1.patch
In aggiunta alle patch richieste in precedenza, esiste un certo numero di patch opzionali create dalla comunità LFS. Queste patch opzionali risolvono problemi minori o abilitano funzionalità che non sono abilitate per default. Si è liberi di esaminare il database delle patch che si trova su http://www.linuxfromscratch.org/patches/ e acquisire ogni patch aggiuntiva che sia adatta alle richieste del sistema.